Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DffaO54786 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DffaO54786 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DffaO54786 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DffaO54786 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DffaO54786 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DffaO54786 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
DffaO54786 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DffaO54786 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DffaO54786 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DffaO54786 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DffaO54786 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DffaO54786 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DffaO54786 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DffaO54786 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DffaO54786 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DffaO54786 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DffaO54786 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DffaO54786 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DffaO54786 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DffaO54786 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DffaO54786 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DffaO54786 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
DffaO54786 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DffaO54786 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DffaO54786 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DffaO54786 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DffaO54786 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DffaO54786 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DffaO54786 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DffaO54786 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DffaO54786 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DffaO54786 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DffaO54786 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DffaO54786 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DffaO54786 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DffaO54786 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DffaO54786 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DffaO54786 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DffaO54786 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DffaO54786 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DffaO54786 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DffaO54786 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DffaO54786 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DffaO54786 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DffaO54786 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DffaO54786 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DffaO54786 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DffaO54786 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DffaO54786 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DffaO54786 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DffaO54786 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DffaO54786 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DffaO54786 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DffaO54786 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DffaO54786 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DffaO54786 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DffaO54786 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DffaO54786 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DffaO54786 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DffaO54786 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DffaO54786 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DffaO54786 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DffaO54786 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DffaO54786 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DffaO54786 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DffaO54786 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DffaO54786 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DffaO54786 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DffaO54786 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DffaO54786 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DffaO54786 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DffaO54786 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DffaO54786 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DffaO54786 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DffaO54786 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DffaO54786 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DffaO54786 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DffaO54786 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DffaO54786 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
DffaO54786 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DffaO54786 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DffaO54786 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
DffaO54786 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DffaO54786 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DffaO54786 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DffaO54786 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DffaO54786 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DffaO54786 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DffaO54786 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DffaO54786 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
DffaO54786 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DffaO54786 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DffaO54786 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
DffaO54786 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DffaO54786 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DffaO54786 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DffaO54786 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DffaO54786 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DffaO54786 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms