Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccr6O54689 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms