Protein–RNA interactions for Protein: O35691

Pnn, Pinin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnnO35691 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PnnO35691 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PnnO35691 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PnnO35691 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PnnO35691 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PnnO35691 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PnnO35691 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PnnO35691 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PnnO35691 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PnnO35691 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PnnO35691 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PnnO35691 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PnnO35691 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PnnO35691 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PnnO35691 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PnnO35691 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PnnO35691 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PnnO35691 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PnnO35691 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PnnO35691 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PnnO35691 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PnnO35691 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PnnO35691 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PnnO35691 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PnnO35691 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PnnO35691 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PnnO35691 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PnnO35691 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PnnO35691 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PnnO35691 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PnnO35691 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PnnO35691 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PnnO35691 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PnnO35691 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PnnO35691 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PnnO35691 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PnnO35691 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PnnO35691 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PnnO35691 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PnnO35691 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PnnO35691 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PnnO35691 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PnnO35691 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PnnO35691 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PnnO35691 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PnnO35691 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PnnO35691 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PnnO35691 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PnnO35691 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PnnO35691 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PnnO35691 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PnnO35691 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PnnO35691 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PnnO35691 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PnnO35691 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PnnO35691 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PnnO35691 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PnnO35691 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PnnO35691 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PnnO35691 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PnnO35691 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PnnO35691 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PnnO35691 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PnnO35691 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PnnO35691 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PnnO35691 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PnnO35691 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PnnO35691 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PnnO35691 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PnnO35691 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PnnO35691 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PnnO35691 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PnnO35691 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PnnO35691 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PnnO35691 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PnnO35691 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PnnO35691 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PnnO35691 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PnnO35691 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PnnO35691 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PnnO35691 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PnnO35691 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PnnO35691 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PnnO35691 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PnnO35691 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PnnO35691 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PnnO35691 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PnnO35691 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PnnO35691 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PnnO35691 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PnnO35691 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PnnO35691 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PnnO35691 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PnnO35691 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PnnO35691 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PnnO35691 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PnnO35691 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PnnO35691 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PnnO35691 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PnnO35691 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms