Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx1aO35526 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx1aO35526 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx1aO35526 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx1aO35526 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx1aO35526 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx1aO35526 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx1aO35526 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx1aO35526 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx1aO35526 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx1aO35526 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx1aO35526 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx1aO35526 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx1aO35526 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx1aO35526 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx1aO35526 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx1aO35526 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx1aO35526 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx1aO35526 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx1aO35526 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx1aO35526 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx1aO35526 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx1aO35526 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx1aO35526 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx1aO35526 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx1aO35526 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx1aO35526 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx1aO35526 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx1aO35526 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx1aO35526 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Stx1aO35526 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Stx1aO35526 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms