Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms