Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Scarb2O35114 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Scarb2O35114 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Scarb2O35114 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Scarb2O35114 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Scarb2O35114 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Scarb2O35114 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Scarb2O35114 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Scarb2O35114 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Scarb2O35114 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Scarb2O35114 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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