Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms