Protein–RNA interactions for Protein: L7N2E3

Gm8050, Predicted gene 8050, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8050L7N2E3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8050L7N2E3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8050L7N2E3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8050L7N2E3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8050L7N2E3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8050L7N2E3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8050L7N2E3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8050L7N2E3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8050L7N2E3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8050L7N2E3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8050L7N2E3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8050L7N2E3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8050L7N2E3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8050L7N2E3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8050L7N2E3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8050L7N2E3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8050L7N2E3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8050L7N2E3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8050L7N2E3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8050L7N2E3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8050L7N2E3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8050L7N2E3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8050L7N2E3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8050L7N2E3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8050L7N2E3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8050L7N2E3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8050L7N2E3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8050L7N2E3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8050L7N2E3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8050L7N2E3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8050L7N2E3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8050L7N2E3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8050L7N2E3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8050L7N2E3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms