Protein–RNA interactions for Protein: J3QN14

Zfp616, Zinc finger protein 616, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp616J3QN14 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp616J3QN14 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms