Protein–RNA interactions for Protein: J3QM76

Ccdc179, Coiled-coil domain-containing protein 179, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc179J3QM76 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms