Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms