Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm28305F6U473 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm28305F6U473 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm28305F6U473 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm28305F6U473 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm28305F6U473 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28305F6U473 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28305F6U473 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28305F6U473 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28305F6U473 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28305F6U473 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28305F6U473 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28305F6U473 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28305F6U473 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28305F6U473 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28305F6U473 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28305F6U473 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28305F6U473 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28305F6U473 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28305F6U473 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28305F6U473 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28305F6U473 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28305F6U473 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28305F6U473 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28305F6U473 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28305F6U473 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28305F6U473 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28305F6U473 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28305F6U473 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28305F6U473 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28305F6U473 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28305F6U473 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28305F6U473 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28305F6U473 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28305F6U473 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28305F6U473 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28305F6U473 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28305F6U473 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28305F6U473 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28305F6U473 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28305F6U473 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28305F6U473 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28305F6U473 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28305F6U473 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28305F6U473 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28305F6U473 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28305F6U473 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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