Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzd7E9Q9W7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzd7E9Q9W7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd7E9Q9W7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd7E9Q9W7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd7E9Q9W7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd7E9Q9W7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd7E9Q9W7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd7E9Q9W7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd7E9Q9W7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd7E9Q9W7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd7E9Q9W7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzd7E9Q9W7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzd7E9Q9W7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzd7E9Q9W7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzd7E9Q9W7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzd7E9Q9W7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzd7E9Q9W7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzd7E9Q9W7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzd7E9Q9W7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzd7E9Q9W7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzd7E9Q9W7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzd7E9Q9W7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzd7E9Q9W7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 207.3 ms