Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc9bA3KGF9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms