Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Palm3A2TJV2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms