Protein–RNA interactions for Protein: A2A5X4

Krtap29-1, Keratin-associated protein 29-1, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap29-1A2A5X4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap29-1A2A5X4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Krtap29-1A2A5X4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Krtap29-1A2A5X4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Krtap29-1A2A5X4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Krtap29-1A2A5X4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Krtap29-1A2A5X4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Krtap29-1A2A5X4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Krtap29-1A2A5X4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Krtap29-1A2A5X4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Krtap29-1A2A5X4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Krtap29-1A2A5X4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Krtap29-1A2A5X4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Krtap29-1A2A5X4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Krtap29-1A2A5X4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Krtap29-1A2A5X4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Krtap29-1A2A5X4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Krtap29-1A2A5X4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Krtap29-1A2A5X4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Krtap29-1A2A5X4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Krtap29-1A2A5X4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Krtap29-1A2A5X4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Krtap29-1A2A5X4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Krtap29-1A2A5X4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Krtap29-1A2A5X4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Krtap29-1A2A5X4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Krtap29-1A2A5X4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms