Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm8004-201ENSMUST00000187782 617 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm20885-201ENSMUST00000190192 654 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm29740-201ENSMUST00000193182 655 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm36866-201ENSMUST00000193343 657 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm36047-201ENSMUST00000193659 657 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm20857-201ENSMUST00000194766 657 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm18428-201ENSMUST00000194986 791 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm38172-201ENSMUST00000195321 567 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm20858-201ENSMUST00000195459 657 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm35212-201ENSMUST00000196672 606 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm43476-201ENSMUST00000197873 405 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm42982-201ENSMUST00000198574 687 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm31532-201ENSMUST00000203555 767 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Cd69-203ENSMUST00000204411 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm38430-201ENSMUST00000209888 1240 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm18414-201ENSMUST00000210858 694 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 AC115047.1-201ENSMUST00000213795 322 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm3428-204ENSMUST00000214488 1020 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 AC166258.1-201ENSMUST00000219823 893 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm36827-201ENSMUST00000220080 1249 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 RMST_1.1-213ENSMUST00000220288 792 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc72-203ENSMUST00000221155 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 CT030260.1-201ENSMUST00000223243 442 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Ropn1-201ENSMUST00000023530 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Morn5-201ENSMUST00000028256 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm16442-201ENSMUST00000079099 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r194-201ENSMUST00000091737 891 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Olfr606-201ENSMUST00000098200 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Slc4a4-208ENSMUST00000156238 3494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 P2ry14-201ENSMUST00000065220 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm45182-201ENSMUST00000207579 2404 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm38099-201ENSMUST00000193280 3170 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm43769-201ENSMUST00000201871 4323 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Akt3-203ENSMUST00000111160 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm37278-201ENSMUST00000191619 2872 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gabpb2-205ENSMUST00000136139 8661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm18305-201ENSMUST00000216532 2128 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Olfr399-202ENSMUST00000215915 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm28718-201ENSMUST00000188417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm28977-201ENSMUST00000188678 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm29612-201ENSMUST00000191490 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Elf5-201ENSMUST00000028609 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm38300-201ENSMUST00000194245 1870 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Impg2-202ENSMUST00000069936 6890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm10778-201ENSMUST00000105315 1497 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm14035-201ENSMUST00000117596 1475 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm4767-201ENSMUST00000099439 1497 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Zfp180-205ENSMUST00000207002 3690 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 1700007E05Rik-201ENSMUST00000186196 1513 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Rtp4-201ENSMUST00000038423 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Ifit3b-201ENSMUST00000076249 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 B830042I05Rik-201ENSMUST00000208333 1620 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Ank3-207ENSMUST00000181974 3751 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Dsg1bQ7TSF1 Gm44950-201ENSMUST00000206403 2296 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Olfr361-201ENSMUST00000100145 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Stmn1-203ENSMUST00000105868 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Dsg1bQ7TSF1 Ly6k-202ENSMUST00000168815 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Prol1-201ENSMUST00000170832 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm8439-201ENSMUST00000171482 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Dsg1bQ7TSF1 Gm28703-201ENSMUST00000185312 1159 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Dsg1bQ7TSF1 Gm44192-201ENSMUST00000204195 556 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm44036-201ENSMUST00000204551 336 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Smarcad1-215ENSMUST00000205118 600 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm45478-201ENSMUST00000209472 211 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gnb1-ps3-201ENSMUST00000212191 950 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm17950-201ENSMUST00000214617 646 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 AC155305.1-201ENSMUST00000222207 319 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 FAM237A-201ENSMUST00000226288 1105 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Agr3-201ENSMUST00000042101 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1323-201ENSMUST00000057071 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Olfr787-201ENSMUST00000077836 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Olfr557-201ENSMUST00000098218 1057 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Ampd3-208ENSMUST00000213373 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Pdgfd-203ENSMUST00000214892 2862 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Eif2ak2-201ENSMUST00000024884 4313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm4319-201ENSMUST00000191139 2048 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Pgbd1-204ENSMUST00000148071 2600 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Atp2b4-201ENSMUST00000048953 8292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm19325-201ENSMUST00000186238 3382 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm5841-201ENSMUST00000195307 2177 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Xlr3a-202ENSMUST00000114524 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Omg-201ENSMUST00000164465 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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