Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Gm21051-201ENSMUST00000221757 1688 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Olfr401-202ENSMUST00000213754 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Cyp2c68-201ENSMUST00000099472 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Olfr60-202ENSMUST00000210932 2383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Gm45001-201ENSMUST00000208279 2515 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Etnppl-201ENSMUST00000072271 4468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Olfr1175-ps-201ENSMUST00000214207 5552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Kif4-ps-201ENSMUST00000184686 3665 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Olfr1390-202ENSMUST00000215014 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm9603-201ENSMUST00000165814 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm3542-201ENSMUST00000169362 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm9311-201ENSMUST00000118042 1269 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm5601-201ENSMUST00000118909 972 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm15621-201ENSMUST00000119162 364 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm12540-201ENSMUST00000121938 319 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm4997-201ENSMUST00000154056 360 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm23968-201ENSMUST00000175047 125 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm28817-201ENSMUST00000187598 830 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm38068-201ENSMUST00000192546 540 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Fcer1a-202ENSMUST00000193017 826 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 AC151967.1-201ENSMUST00000198146 76 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Trav15n-2-201ENSMUST00000199112 398 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Trav15d-2-dv6d-2-201ENSMUST00000199800 398 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm43786-202ENSMUST00000202157 616 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm43929-201ENSMUST00000203025 409 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm44442-201ENSMUST00000204298 422 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 AC122273.1-202ENSMUST00000213884 695 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 AC165349.1-201ENSMUST00000217896 424 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 AC117769.2-201ENSMUST00000224612 469 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 AC154640.3-201ENSMUST00000227492 846 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Olfr122-204ENSMUST00000217119 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm43187-201ENSMUST00000200652 2397 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Vmn2r114-201ENSMUST00000168033 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm45876-201ENSMUST00000212698 2709 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm45250-201ENSMUST00000209414 3592 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Celf2-226ENSMUST00000183209 3852 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Pcbp2-203ENSMUST00000108838 2775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Chn1-202ENSMUST00000102677 3760 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Prkg2-204ENSMUST00000162147 1389 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Nck1-201ENSMUST00000112874 1513 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Nexn-201ENSMUST00000046045 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm26981-201ENSMUST00000182453 3169 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Tlr4-202ENSMUST00000107365 1866 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm12842-201ENSMUST00000117298 476 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm12229-201ENSMUST00000120487 468 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm3810-201ENSMUST00000122413 476 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Zcchc7-208ENSMUST00000147272 4251 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm16297-201ENSMUST00000161466 459 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm9064-201ENSMUST00000163579 566 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Ubtfl1-202ENSMUST00000164441 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm17079-201ENSMUST00000167231 666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm3585-201ENSMUST00000173438 875 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm9285-201ENSMUST00000177691 697 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm26607-201ENSMUST00000180661 867 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Matr3-215ENSMUST00000190121 2638 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms