Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Slamf7-202ENSMUST00000192024 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm42636-201ENSMUST00000197174 2239 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm14870-201ENSMUST00000118414 156 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm26023-201ENSMUST00000122722 313 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm37609-201ENSMUST00000191778 678 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm9292-201ENSMUST00000222008 710 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 AC158954.1-201ENSMUST00000228272 1006 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 4930550C14Rik-201ENSMUST00000005262 1237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Adgrl2-213ENSMUST00000199059 4637 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm42568-201ENSMUST00000195639 1841 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Zfp827-202ENSMUST00000098614 7581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Mettl21e-201ENSMUST00000054801 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Cdh23-202ENSMUST00000105461 11096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Disp2-201ENSMUST00000037547 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Tanc1-208ENSMUST00000139863 7246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Ctnnd1-218ENSMUST00000111692 6170 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 4933406C10Rik-202ENSMUST00000181670 1633 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Crb1-201ENSMUST00000059825 5901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm28333-201ENSMUST00000186034 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm28718-201ENSMUST00000188417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm28977-201ENSMUST00000188678 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm28315-201ENSMUST00000189948 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm29612-201ENSMUST00000191490 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Plxna4-201ENSMUST00000115096 12877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm16170-201ENSMUST00000156882 3754 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 A330015K06Rik-201ENSMUST00000195489 4286 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Kyat3-201ENSMUST00000044392 4206 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 D5Ertd577e-202ENSMUST00000202481 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Myo5c-201ENSMUST00000036555 6727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Akr1c20-201ENSMUST00000078239 1317 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm21663-201ENSMUST00000196214 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm23030-201ENSMUST00000158004 273 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 B230118H07Rik-208ENSMUST00000160037 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
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Col5a3Q9JLI2 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm10688-201ENSMUST00000214985 520 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm46401-201ENSMUST00000221291 1089 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Mir298-201ENSMUST00000083476 82 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm45221-201ENSMUST00000207822 2272 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Elp2-201ENSMUST00000025120 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Nkrf-201ENSMUST00000057093 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Ttk-202ENSMUST00000185913 2731 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Ick-202ENSMUST00000044551 6560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
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Col5a3Q9JLI2 Olfr686-203ENSMUST00000216143 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Ank3-231ENSMUST00000182884 9963 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Olfr1189-202ENSMUST00000213679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Rnmt-201ENSMUST00000009679 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Cwc22-202ENSMUST00000111818 3255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 A530076I17Rik-202ENSMUST00000228352 1524 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Pcdh15-225ENSMUST00000149977 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Ap3s2-201ENSMUST00000075657 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Casr-201ENSMUST00000063597 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Myo6-205ENSMUST00000127779 4067 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Slco2b1-202ENSMUST00000107086 3993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Adgrl3-208ENSMUST00000118442 5101 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 3110043O21Rik-202ENSMUST00000108126 2644 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Cyp1a1-201ENSMUST00000034865 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Tep1-201ENSMUST00000006444 8171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Skil-202ENSMUST00000117728 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Smim8-203ENSMUST00000108132 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Snora47-201ENSMUST00000157483 138 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm22724-201ENSMUST00000158091 127 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm28883-201ENSMUST00000189256 369 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm42437-201ENSMUST00000197263 923 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm45350-201ENSMUST00000210560 509 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm7570-201ENSMUST00000215246 698 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm39329-201ENSMUST00000215849 798 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 CAAA01125382.4-201ENSMUST00000217222 774 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Glipr1l3-201ENSMUST00000220085 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm9088-201ENSMUST00000220237 508 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Olfr777-201ENSMUST00000080313 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm10184-201ENSMUST00000086423 1939 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Deup1-202ENSMUST00000115592 2918 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm42507-201ENSMUST00000201187 2555 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
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