Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm26652-201ENSMUST00000180592 373 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 1700054K02Rik-201ENSMUST00000181755 376 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm29337-201ENSMUST00000185425 284 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 AC099760.1-201ENSMUST00000196300 153 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Trav13n-1-201ENSMUST00000198359 331 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm43538-201ENSMUST00000200416 849 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm10610-203ENSMUST00000208877 1206 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Camta1-213ENSMUST00000214673 243 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Ear14-202ENSMUST00000228064 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Olfr266-201ENSMUST00000059486 1027 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Ccr1l1-201ENSMUST00000071404 1166 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Olfr177-201ENSMUST00000072853 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Ganab-201ENSMUST00000096246 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm43526-201ENSMUST00000196666 1565 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm35439-201ENSMUST00000200051 4809 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm42996-201ENSMUST00000196116 1636 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm15448-203ENSMUST00000108620 1828 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Snx27Q3UHD6 Gm45084-201ENSMUST00000207096 1957 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Snx27Q3UHD6 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Snx27Q3UHD6 Gm28240-201ENSMUST00000187560 2053 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Snx27Q3UHD6 Fmo9-202ENSMUST00000148677 2462 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Snx27Q3UHD6 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Snx27Q3UHD6 Gm28856-201ENSMUST00000189150 2828 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Snx27Q3UHD6 Ap1g1-201ENSMUST00000034171 3692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Snx27Q3UHD6 Gcnt2-202ENSMUST00000069958 3929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Snx27Q3UHD6 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Snx27Q3UHD6 Smad5-202ENSMUST00000109874 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Snx27Q3UHD6 Ide-201ENSMUST00000131070 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx27Q3UHD6 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx27Q3UHD6 Gm45528-201ENSMUST00000209854 3145 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx27Q3UHD6 Olfr193-203ENSMUST00000208455 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx27Q3UHD6 Gm26843-201ENSMUST00000212304 2859 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx27Q3UHD6 AC155234.1-201ENSMUST00000225610 2823 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx27Q3UHD6 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx27Q3UHD6 Efcab7-201ENSMUST00000097959 1713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx27Q3UHD6 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx27Q3UHD6 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx27Q3UHD6 Tmem156-204ENSMUST00000212080 1411 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx27Q3UHD6 Frem1-208ENSMUST00000170248 9527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx27Q3UHD6 Dsg1b-201ENSMUST00000076737 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx27Q3UHD6 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx27Q3UHD6 Gm22284-201ENSMUST00000104132 132 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
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Snx27Q3UHD6 Gm4985-201ENSMUST00000118300 1233 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Snx27Q3UHD6 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx27Q3UHD6 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
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Snx27Q3UHD6 Gm16152-201ENSMUST00000131663 872 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx27Q3UHD6 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx27Q3UHD6 1700047F07Rik-201ENSMUST00000140321 543 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Snx27Q3UHD6 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx27Q3UHD6 AC153955.3-201ENSMUST00000216787 646 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx27Q3UHD6 AC131795.1-201ENSMUST00000219632 426 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx27Q3UHD6 Smim15-203ENSMUST00000224361 830 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx27Q3UHD6 Cetn1-201ENSMUST00000062769 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx27Q3UHD6 Gm8444-201ENSMUST00000092020 357 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx27Q3UHD6 Olfr1474-201ENSMUST00000096202 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx27Q3UHD6 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx27Q3UHD6 Gm36527-201ENSMUST00000195500 3029 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx27Q3UHD6 Olfr1346-203ENSMUST00000215302 4525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx27Q3UHD6 Zfp143-205ENSMUST00000211798 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx27Q3UHD6 Gm17491-201ENSMUST00000180411 2311 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx27Q3UHD6 Lilra6-204ENSMUST00000206077 2281 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx27Q3UHD6 Gm37745-201ENSMUST00000193304 8163 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx27Q3UHD6 Pdlim5-205ENSMUST00000170361 2010 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx27Q3UHD6 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Snx27Q3UHD6 Rgsl1-203ENSMUST00000141249 1752 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Snx27Q3UHD6 Frs2-201ENSMUST00000020381 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Snx27Q3UHD6 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Snx27Q3UHD6 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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