Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 1700102P08Rik-201ENSMUST00000035234 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Olfr1386-201ENSMUST00000071905 1128 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Olfr177-201ENSMUST00000072853 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Vmn1r37-201ENSMUST00000077482 909 ntAPPRIS P2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Platr26-201ENSMUST00000079720 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Kmo-202ENSMUST00000097458 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 2700062C07Rik-201ENSMUST00000097646 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Nek7-203ENSMUST00000187407 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Mak-206ENSMUST00000225084 3573 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Gabpb2-205ENSMUST00000136139 8661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Arhgef3-202ENSMUST00000224981 3618 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Gm42996-201ENSMUST00000196116 1636 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Olfr994-204ENSMUST00000217218 1460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Nbas-201ENSMUST00000042953 7234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Agtpbp1-201ENSMUST00000022040 8174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Gm28231-201ENSMUST00000190118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 AC161247.1-201ENSMUST00000217744 2295 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Pabpc4l-202ENSMUST00000192793 5252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Olfr15-202ENSMUST00000214238 6135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Scaper-201ENSMUST00000037408 5158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Impg1-202ENSMUST00000113250 2965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 B930025P03Rik-201ENSMUST00000207718 3085 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Gm7980-201ENSMUST00000168107 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Tmem156-204ENSMUST00000212080 1411 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Zfp712-201ENSMUST00000167565 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Mir760-201ENSMUST00000103257 119 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Ncald-202ENSMUST00000116445 858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Gm6181-201ENSMUST00000117187 264 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Gm15081-201ENSMUST00000119794 844 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Gm14847-201ENSMUST00000121978 519 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Gm25782-201ENSMUST00000122526 289 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Prlr-204ENSMUST00000128450 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Gm22428-201ENSMUST00000158554 132 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Gm5861-201ENSMUST00000168407 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Gm27014-201ENSMUST00000182658 937 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 1700108F19Rik-207ENSMUST00000191384 210 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Gm30517-201ENSMUST00000197350 772 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Gm44571-201ENSMUST00000208092 533 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Gm2221-201ENSMUST00000209342 418 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 AC153897.1-201ENSMUST00000213510 470 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 AC155270.1-202ENSMUST00000221503 352 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 AC127242.3-201ENSMUST00000222009 580 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 AC165157.1-201ENSMUST00000222981 580 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 AC163660.1-201ENSMUST00000223696 818 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Olfr19-201ENSMUST00000057886 1142 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Hamp2-201ENSMUST00000074671 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Olfr195-201ENSMUST00000075381 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Gm6436-201ENSMUST00000077163 451 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Gcc2-207ENSMUST00000162041 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Lrp2-201ENSMUST00000080953 15460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Olfr669-203ENSMUST00000214260 2336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Kif4-ps-201ENSMUST00000184686 3665 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Dab2-201ENSMUST00000078019 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Olfr559-202ENSMUST00000215657 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Gm28379-202ENSMUST00000187676 2896 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Ncoa6-202ENSMUST00000109669 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Gm20043-201ENSMUST00000222267 2565 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Lingo2-202ENSMUST00000098151 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Atp2b4-207ENSMUST00000165602 8101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Rps12-ps10-201ENSMUST00000117447 399 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Gm14116-201ENSMUST00000117733 805 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Rps12-ps16-201ENSMUST00000118529 399 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Gm13930-201ENSMUST00000118569 368 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Apc-ps1-201ENSMUST00000119356 470 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PcolceQ61398 Gm14938-201ENSMUST00000119482 943 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms