Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms