Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clca3a1Q9QX15 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clca3a1Q9QX15 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clca3a1Q9QX15 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clca3a1Q9QX15 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clca3a1Q9QX15 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clca3a1Q9QX15 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clca3a1Q9QX15 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clca3a1Q9QX15 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clca3a1Q9QX15 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clca3a1Q9QX15 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clca3a1Q9QX15 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clca3a1Q9QX15 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clca3a1Q9QX15 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clca3a1Q9QX15 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clca3a1Q9QX15 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clca3a1Q9QX15 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clca3a1Q9QX15 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clca3a1Q9QX15 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clca3a1Q9QX15 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clca3a1Q9QX15 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clca3a1Q9QX15 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clca3a1Q9QX15 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clca3a1Q9QX15 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clca3a1Q9QX15 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clca3a1Q9QX15 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms