Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Rabgef1Q9JM13 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Rabgef1Q9JM13 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Rabgef1Q9JM13 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Rabgef1Q9JM13 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Rabgef1Q9JM13 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Rabgef1Q9JM13 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Rabgef1Q9JM13 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Rabgef1Q9JM13 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Rabgef1Q9JM13 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Rabgef1Q9JM13 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Rabgef1Q9JM13 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
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