Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim39Q9ESN2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Trim39Q9ESN2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Trim39Q9ESN2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trim39Q9ESN2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trim39Q9ESN2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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