Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OtofQ9ESF1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OtofQ9ESF1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OtofQ9ESF1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OtofQ9ESF1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OtofQ9ESF1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OtofQ9ESF1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OtofQ9ESF1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OtofQ9ESF1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OtofQ9ESF1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OtofQ9ESF1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OtofQ9ESF1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OtofQ9ESF1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OtofQ9ESF1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OtofQ9ESF1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms