Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms