Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP93

Vmn1r53, Vomeronasal type-1 receptor 53, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r53Q9EP93 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r53Q9EP93 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r53Q9EP93 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r53Q9EP93 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r53Q9EP93 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r53Q9EP93 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r53Q9EP93 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r53Q9EP93 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r53Q9EP93 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r53Q9EP93 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r53Q9EP93 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r53Q9EP93 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r53Q9EP93 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r53Q9EP93 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r53Q9EP93 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r53Q9EP93 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r53Q9EP93 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r53Q9EP93 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r53Q9EP93 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r53Q9EP93 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r53Q9EP93 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r53Q9EP93 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r53Q9EP93 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r53Q9EP93 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r53Q9EP93 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r53Q9EP93 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r53Q9EP93 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r53Q9EP93 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r53Q9EP93 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r53Q9EP93 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r53Q9EP93 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r53Q9EP93 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r53Q9EP93 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r53Q9EP93 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r53Q9EP93 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r53Q9EP93 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r53Q9EP93 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r53Q9EP93 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r53Q9EP93 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r53Q9EP93 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r53Q9EP93 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms