Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Derl3Q9D8K3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Derl3Q9D8K3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Derl3Q9D8K3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Derl3Q9D8K3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Derl3Q9D8K3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Derl3Q9D8K3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Derl3Q9D8K3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Derl3Q9D8K3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Derl3Q9D8K3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Derl3Q9D8K3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Derl3Q9D8K3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Derl3Q9D8K3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Derl3Q9D8K3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Derl3Q9D8K3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Derl3Q9D8K3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms