Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chmp5Q9D7S9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms