Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc7Q9D541 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms