Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT6

Cmss1, Protein CMSS1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmss1Q9CZT6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms