Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms