Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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