Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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