Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRY7

Gdpd1, Lysophospholipase D GDPD1, mousemouse

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd1Q9CRY7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Gdpd1Q9CRY7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Gdpd1Q9CRY7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Gdpd1Q9CRY7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Gdpd1Q9CRY7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Gdpd1Q9CRY7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Gdpd1Q9CRY7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Gdpd1Q9CRY7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Gdpd1Q9CRY7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Gdpd1Q9CRY7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms