Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms