Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ76

Nepn, Nephrocan, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NepnQ9CQ76 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NepnQ9CQ76 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms