Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms