Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CsprsQ99388 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CsprsQ99388 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CsprsQ99388 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CsprsQ99388 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CsprsQ99388 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CsprsQ99388 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CsprsQ99388 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CsprsQ99388 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CsprsQ99388 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CsprsQ99388 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CsprsQ99388 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CsprsQ99388 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CsprsQ99388 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CsprsQ99388 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CsprsQ99388 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CsprsQ99388 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CsprsQ99388 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CsprsQ99388 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CsprsQ99388 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CsprsQ99388 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CsprsQ99388 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CsprsQ99388 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CsprsQ99388 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CsprsQ99388 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CsprsQ99388 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CsprsQ99388 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CsprsQ99388 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CsprsQ99388 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CsprsQ99388 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CsprsQ99388 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CsprsQ99388 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CsprsQ99388 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CsprsQ99388 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CsprsQ99388 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CsprsQ99388 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CsprsQ99388 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CsprsQ99388 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CsprsQ99388 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CsprsQ99388 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CsprsQ99388 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CsprsQ99388 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CsprsQ99388 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CsprsQ99388 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CsprsQ99388 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CsprsQ99388 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CsprsQ99388 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CsprsQ99388 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms