Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms