Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms