Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Hpf1Q8CFE2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
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Hpf1Q8CFE2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Hpf1Q8CFE2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Hpf1Q8CFE2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
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Hpf1Q8CFE2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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