Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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