Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
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Usp20Q8C6M1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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Usp20Q8C6M1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Usp20Q8C6M1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Usp20Q8C6M1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Usp20Q8C6M1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Usp20Q8C6M1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Usp20Q8C6M1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp20Q8C6M1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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