Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
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Pggt1bQ8BUY9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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Pggt1bQ8BUY9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pggt1bQ8BUY9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pggt1bQ8BUY9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pggt1bQ8BUY9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pggt1bQ8BUY9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
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Pggt1bQ8BUY9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pggt1bQ8BUY9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pggt1bQ8BUY9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pggt1bQ8BUY9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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Pggt1bQ8BUY9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Pggt1bQ8BUY9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pggt1bQ8BUY9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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Pggt1bQ8BUY9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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Pggt1bQ8BUY9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pggt1bQ8BUY9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pggt1bQ8BUY9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pggt1bQ8BUY9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pggt1bQ8BUY9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pggt1bQ8BUY9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pggt1bQ8BUY9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pggt1bQ8BUY9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pggt1bQ8BUY9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pggt1bQ8BUY9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pggt1bQ8BUY9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pggt1bQ8BUY9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms