Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms