Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGB5

Limd2, LIM domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd2Q8BGB5 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Limd2Q8BGB5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms