Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Katnb1Q8BG40 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms