Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ell3Q80VR2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ell3Q80VR2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ell3Q80VR2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ell3Q80VR2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ell3Q80VR2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ell3Q80VR2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ell3Q80VR2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ell3Q80VR2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ell3Q80VR2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ell3Q80VR2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ell3Q80VR2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ell3Q80VR2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ell3Q80VR2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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